Containertransport heeft zowel positieve als negatieve milieueffecten.

Positief is dat het gebruik van containers de efficiëntie in de transportsector verhoogt, waardoor brandstofverbruik per eenheid lading wordt verminderd.

Door standaardisatie kunnen containers via verschillende transportmodaliteiten worden verplaatst zonder herladen van de lading, wat de CO₂-uitstoot vermindert.

Containers zijn daarnaast duurzaam, omdat ze hergebruikt kunnen worden voor opslag, woonruimtes, en andere toepassingen.

Aan de andere kant draagt containertransport bij aan vervuiling door de uitstoot van schepen, vrachtwagens en treinen die ze vervoeren.

Maritiem transport veroorzaakt bijvoorbeeld uitstoot van zwaveloxiden (SOx) en stikstofoxiden (NOx), die schadelijk zijn voor het milieu.

Om de impact te verminderen, gebruiken steeds meer rederijen schonere brandstoffen of investeren ze in energiezuinige technologieën, zoals schepen met LNG-aandrijving en hybride vrachtwagens.

Het gebruik van containers heeft dus zowel voordelen voor de efficiëntie als uitdagingen op het gebied van duurzaamheid.