Containers worden regelmatig onderhouden en gerepareerd om hun veiligheid en bruikbaarheid te garanderen, vooral als ze intensief worden gebruikt voor transport.

Het onderhoud omvat meestal roestpreventie, waarbij roestplekken worden verwijderd en overgeschilderd met roestwerende verf om corrosie te voorkomen.

Ook worden afdichtingen en sloten gecontroleerd om ervoor te zorgen dat ze nog goed werken en geen vocht doorlaten.

Containers die structurele schade hebben, zoals deuken of scheuren in de wanden, worden vaak gelast of vervangen door nieuwe panelen om de sterkte te herstellen.

De vloer van de container kan ook slijten door veelvuldig laden en lossen en kan worden vervangen of versterkt als dat nodig is.

Daarnaast worden speciale containers, zoals reefers, regelmatig gecontroleerd op de werking van hun koelsystemen. Door regelmatig onderhoud blijven containers in goede staat en geschikt voor veilige opslag en transport over lange afstanden.